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oceanguard-biodex
asferrer/oceanguard-biodex
oceanguard-biodex is a machine learning model from asferrer. Use it for the machine learning task on the model card, and read the license before you ship it in a product. The card lists the license as mit.
Assets descargables on-demand por la app OceanGuard AI para la identificación on-device de especies marinas (track BioDex), vía RAG visual.
Access
Public
Updated May 27, 2026
Repo size
711 MB
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.onnx352 MB · 99%
At a glance
- License
- mit
- Access
- Public
- Created
- May 27, 2026
- Updated
- May 27, 2026
- SHA
- ef8e40ca
Model card
From the Hugging Face model README
OceanGuard AI — BioDex assets (visual species RAG)
Assets descargables on-demand por la app OceanGuard AI para la identificación on-device de especies marinas (track BioDex), vía RAG visual.
Contenido
| Fichero | Descripción |
|---|---|
clip_vitb32.onnx | Encoder visual OpenCLIP ViT-B/32 (LAION-2B), exportado a ONNX (fp32). Input pixel_values[b,3,224,224] (normalización CLIP), output image_features[b,512] L2-norm. |
species_index_v1.bin | Índice de prototipos (1218 vectores, 203 especies, k=6 por especie) sobre 5788 imágenes reales. Expansión Mediterráneo (BioDex v2): 27 especies semilla + 176 especies mediterráneas (peces óseos, tiburones/rayas, tortugas, mamíferos, cefalópodos, otros moluscos, equinodermos, cnidarios, crustáceos, esponjas, fanerógamas/macroalgas, tunicados, anélidos). Formato autocontenido (header SPEX + float16 + trailer JSONL). |
species_catalog_v1.json | Catálogo: nombres científicos + comunes (6 idiomas), AphiaID, ecorregiones MEOW, IUCN. |
meow_raster_v1.bin | Ráster MEOW 0.25° (lat/lon → ecorregión). Construido del shapefile MEOW real (TNC, Spalding et al. 2007): 232 ecorregiones, 62 provincias, 12 realms. |
ecoregion_hierarchy_v1.json | Jerarquía ecorregión → provincia → realm MEOW. |
Calidad (retrieval, held-out)
OpenCLIP ViT-B/32 zero-shot (sin fine-tuning), medido sobre el set semilla de 27 especies, split 70/30 (383 train / 164 held-out): top-1 = 84.1 %, top-5 = 98.2 %. Supera el gate inicial del proyecto (top-1 ≥ 65 %, top-5 ≥ 85 %). La expansión a 203 especies (BioDex v2) amplía la cobertura mediterránea; re-evaluar el retrieval sobre el nuevo conjunto está pendiente.
Procedencia y licencias
- Imágenes de referencia: iNaturalist + GBIF (research-grade, CC-BY / CC0).
Las imágenes NO se redistribuyen aquí; solo los embeddings derivados. La
atribución por imagen está en
provenance.jsonldel pipeline. - Encoder: OpenCLIP ViT-B/32 LAION-2B — licencia MIT.
- MEOW (Spalding et al. 2007): TNC, libre con atribución.
Notas
- Ráster MEOW + distribuciones por especie son reales (shapefile TNC + ocurrencias OBIS/GBIF; 168 especies con ecorregiones reales, 35 cosmopolitas exentas). El filtro geográfico degrada con elegancia (cosmopolitas y sin-datos nunca se excluyen).
- Encoder en fp32 (352 MB); fp16 pendiente por incompatibilidad de fusión LayerNorm en ONNX Runtime.
Generado por finetune/species/ del repo OceanguardAI-App.
- License
- mit
- Created
- May 27, 2026
- Updated
- May 27, 2026